陣屋門の瓦は，これまでにも何度か葺き替えられてきました。今回の改修でも，瓦は傷みが激しかったため，すべてを交換することになりました。
一口に「瓦」といっても，いろいろな種類があります。
まず，屋根の大棟両側にあるしゃちほこは，現存する最古のもの（制作年代は不明）をモデルに制作しました。担当したのは，滋賀県大津市の美濃邉鬼瓦工房。代表を務める美濃邉惠一氏は，ＮＨＫの「プロフェッショナル」でも紹介された，一流の鬼師（鬼瓦職人）です。もちろん，しゃちほこの下にある鬼瓦も，美濃邉鬼瓦工房にお願いしました。
なお，今回の改修では，鬼瓦にあしらう府中松平家の家紋を，「替紋」から「定紋」に改めています。江戸時代，それぞれの家は，公式に用いる「定紋」（「表紋」「本紋」「正紋」などとも言う）のほか，「替紋」（「裏紋」「別紋」「副紋」「控紋」などとも言う）も用いました。府中松平家は，定紋に「隅切角内葵巴紋」，「替紋」に「花葵紋」を用いており，これまでの鬼瓦には「替紋」があしらわれていました。
「替紋」がいつから鬼瓦に用いられていたのか定かでありませんが（明治以降，破損のたびに改修が繰り返されたと思われますが，記録が残っていません），門の顔ともいえる鬼瓦には，一般的に定紋が用いられていることから，今回，「隅切角内葵巴紋」に改めることとしました。
屋根全体に用いられる桟瓦，軒先の軒瓦は，石岡市内で瓦制作を行っている桜井瓦工業が担当。桜井瓦工業の櫻井茂幸氏は，第25回技能コンクール（かわらぶき部門）で内閣総理大臣賞を受けるなど，第一線で活躍している瓦葺師です。
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▲隅切角内葵巴紋（定紋） |
▲花葵紋（替紋） |
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| ▲現存する陣屋門最古のしゃちほこ |